太湖流域是我國經濟最發達的地區之一，在經濟快速發展過程中，由于人類活動的影響，太湖流域水生態系統受到了不同程度的破壞，水質污染十分嚴重，直接影響到人們的生活和健康，制約當地社會經濟的科學發展。開展太湖流域水生態功能分區，并在此基礎上開展面向水質目標管理的污染控制單元的劃分，實現污染物負荷在控制單元內的削減，促進太湖流域水生態系統向良性方向發展，實現人類與自然的和諧發展，具有很大的現實意義。
　　本書共分10章。第1章緒論介紹了流域水生態功能分區的背景、目的、意義、必要性，以及國內外相關研究進展;第2章介紹了太湖流域現有的水功能分區、水環境功能分區、水資源分區、生態分區，分析了相關分區與水生態功能分區的關系;第3章介紹了水生態系統形成的地貌、氣候、土壤、植被覆蓋等自然基礎，分析了經濟總量、產業結構、人口、城鎮化等流域社會經濟發展和污染物排放的關系，以及與水生態演變相關的土地利用變化和水資源及其利用;第4章分浮游植物、浮游動物、底棲動物、水生維管束植物和魚類介紹了太湖流域水生態現狀，并對其種類組成、數量、多樣性、與水質污染的關系進行了分析坪價;第5章系統介紹了太湖流域水生態功能分區思路、工作框架和分區過程，一、二、三級水生態功能分區的目的、原則、指標體系和分區方法;第6章詳細介紹了太湖流域水生態功能一、二、三級分區方案;第7章介紹了太湖流域一、二、三級水生態功能區的環境和自然地理特征;第8章介紹了太湖流域一、二、三級水生態功能區的社會經濟和土地利用特征;第9章對太湖流域水生態系統進行了分區評價;第10章設計了流域生態風險坪價的指標體系和評價方法，從生態風險源危險度、生態環境脆弱度、生態風險受體潛在損失度三方面對太湖流域生態風險進行了分析評價，最后得出了各水生態功能區的綜合生態風險程度。